2000年，凭借长篇处女作《绑架门口狗》而出道，该影片围绕一只狗的安危叙述故事。2003年，拍摄惊悚悬疑片《杀人记忆》，影片取材于一个真实的连环杀人案，讲述了一个充满悬疑色彩的故事，由宋康昊、金相庆和刘胜穆等主演，该片先后获得了第2届大韩民国电影奖最佳导演奖，第2届大韩民国电影奖最佳剧本/编剧奖，第16届东京电影节亚洲最佳电影奖，第40届大钟奖最佳导演奖，第51届圣巴塞斯蒂安国际电影节新人导演奖和FIPRESCI奖以及釜山电影评论联合会最佳剧本奖，奉俊昊获得第2届韩国电影大奖最佳导演 。2004年，奉俊昊与石井聪互、余力为各自拍摄30分钟左右的数码短片《三人三色》 。2006年，奉俊昊创作了整整3年时间的科幻片《汉江怪物》，以一个传统韩国家庭面对汉江怪物为题材，由宋康昊、裴斗娜等主演，获得第44届韩国电影大钟奖最佳导演 。2009年，拍摄惊悚悬疑片《母亲》，由金惠子、元斌、秦久等主演，该影片获得获美国洛杉矶影评人协会奖，并代表韩国角逐第81届奥斯卡金像奖最佳外语片 。2013年，执导改编自比利时同名漫画的动作科幻片《雪国列车》，这是他第五部长片，该影片获得亚太电影节7项提名 。2014年，首次担任惊悚片《海雾》的制片，由金允石、朴有天、李熙俊等主演，该片刻画了走私船上人们的悲剧故事，代表韩国角逐第87届奥斯卡金像奖最佳外语片的作品 。2016年，执导的新片《玉子》将于4月20日开机，2017年上映 。